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代謝紊亂包括葡萄糖,碳水化合物和脂肪的異常以及礦物質代謝,包括肥胖和骨質疏松癥,所有這些都可能具有中樞,外周和遺傳原因。最常見的內分泌疾病是糖尿病,其可歸因於胰島素缺乏(I型),胰島素抵抗(II型)或妊娠糖尿病。甲狀腺疾病包括甲狀腺毒癥,甲狀腺功能減退癥和甲狀腺腫,包括甲狀腺結節和甲狀腺癌。垂體腺疾病包括諸如肢端肥大癥,庫欣氏病,催乳素瘤和垂體功能減退癥的疾病,包括生長激素缺乏和矮身材,不育癥,尿崩癥,Rathke's囊腫和顱咽管瘤。腎上腺功能障礙包括阿狄森氏病,先天性腎上腺增生,康恩綜合征,嗜鉻細胞瘤和腎上腺腫瘤,可以是功能亢進,無功能,良性或惡性。卵巢和睪丸的性腺疾病包括PCOS,卵巢早衰和雄性更年期和性腺機能減退/睪酮缺乏。骨礦物質代謝的亞專業興趣包括骨質疏松癥和其他不常見的骨骼疾病,如骨軟化癥和纖維發育不良。礦物質和電解質代謝紊亂還包括高鈣血癥,低鈣血癥,甲狀旁腺功能亢進和維生素D缺乏以及低鹽,鈉,鉀,鎂和磷酸鹽水平。